ต่อไปนี้เป็นโรคหรือภาวะแทรกซ้อนที่สำคัญที่สุดที่อาจเกิดจากโรคมือเท้าปาก (HFMD):
ผิว และใต้ผิวหนัง (L00-L99)
- Onycholysis (การถอดแผ่นเล็บบางส่วนออกจากเตียงเล็บ) หรือ onychomadesis (การถอดแผ่นเล็บออกจากเตียงเล็บอย่างสมบูรณ์) - ในหลักสูตรที่ผิดปกติ: การสูญเสียเล็บและ เล็บเท้า (โดยปกติภายในสี่สัปดาห์หลังการติดเชื้อ)
จิตใจ - ระบบประสาท (F00-F99; G00-G99)
- สมองอักเสบ (การอักเสบของสมอง) ปลอดเชื้อ (หายากมาก)
- อาการไขสันหลังอักเสบ (เยื่อหุ้มสมองอักเสบ) ปลอดเชื้อ (หายากมาก)
- อัมพฤกษ์ (อัมพาต) คล้ายโปลิโอ
