ซัลเฟต chondroitin (CS) จัดเป็นสมาชิกของ glycosaminoglycans (GAGs) หรือที่เรียกว่า mucopolysaccharides ซึ่งเป็นกลุ่มคาร์โบไฮเดรตที่เป็นส่วนประกอบสำคัญของโปรตีโอไกลแคน glycosaminoglycans ทั้งหมดประกอบด้วยหน่วย disaccharide ที่เชื่อมโยงกับ 1,4-glycosidically ในกรณีของ chondroitins กรดซัลฟูริก ติดอยู่เป็นประจำ ออกซิเจน or ก๊าซไนโตรเจน อะตอมจึงมักจะทำปฏิกิริยาเป็นกรดอย่างรุนแรง คอนดรอยตินซัลเฟต A และ C ประกอบด้วยกรดกลูคูโรนิกและ N-acetyl-D-galactosamine ซัลเฟต chondroitin B มีโครงสร้างที่คล้ายกัน เป็นที่รู้จักกันในชื่อ dermatan sulfate หรือ beta-เฮ จากกรด L-iduronic และ NAG-4-sulfate
ในอีกด้านหนึ่ง chondroitin ซัลเฟต เข้าสู่ร่างกายทางอาหาร พบได้ในเนื้อสัตว์และสัตว์ทะเลโดยเฉพาะในหอยแมลงภู่และหอยนางรม ในทางกลับกันไกลโคซามิโนไกลแคนสามารถเกิดขึ้นในร่างกายได้เอง ต้องมีการสังเคราะห์จากภายนอก กลูโคซา ซัลเฟตซึ่งเป็นสารตั้งต้นที่ต้องการสำหรับการสังเคราะห์ทางชีวภาพของไกลโคซามิโนไกลแคน คอนดรอยตินซัลเฟตซึ่งเป็นโปรตีโอไกลแคนจากสัตว์ส่วนใหญ่รวมอยู่ใน กระดูกอ่อน เนื้อเยื่อจึงเป็นตัวแทนของส่วนประกอบระหว่างเซลล์หลักของ เนื้อเยื่อเกี่ยวพัน, กระดูกอ่อน และกระดูก อย่างไรก็ตามสามารถพบได้ใน ผิว และเมือกในร่างกาย
ในทางเทคนิค chondroitin ซัลเฟตเคยได้รับจากปลาฉลาม กระดูกอ่อนและต่อมาจาก tracheids วัวและสุกรตามลำดับ