ต่อไปนี้เป็นโรคหรือภาวะแทรกซ้อนที่สำคัญที่สุดที่อาจเกิดจากการติดเชื้อไวรัสคอกซากี:
โรคต่อมไร้ท่อโภชนาการและการเผาผลาญ (E00-E90)
- โรคเบาหวานประเภท 1
- ไทรอยด์อักเสบ (การอักเสบของต่อมไทรอยด์)
ผิวหนังและใต้ผิวหนัง (L00-L99)
- ได้รับ onychodystrophy (การเจริญเติบโตของเล็บที่มีพยาธิสภาพ) ของเล็บเท้าที่ดีทั้งสองข้างที่มี onychomadesis (การถอดแผ่นเล็บออกจากเตียงเล็บ) และ leukonychia (จุดสีขาวบนเล็บ) รองจากโรคมือเท้าปากและเท้าเปื่อย Coxsackie A6 (ภาวะแทรกซ้อนในช่วงปลาย )
ระบบหัวใจและหลอดเลือด (I00-I99)
- myocarditis (การอักเสบของ หัวใจ กล้ามเนื้อ).
- เยื่อหุ้มหัวใจอักเสบ (การอักเสบของเยื่อหุ้มหัวใจ)
Psyche - ระบบประสาท (F00-F99; G00-G99)
- อาการไขสันหลังอักเสบ (เยื่อหุ้มสมองอักเสบ).
- เยื่อหุ้มสมองอักเสบ (รวมกัน การอักเสบของสมอง (โรคไข้สมองอักเสบ) and เยื่อหุ้มสมอง (อาการไขสันหลังอักเสบ))
- อัมพาต